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以實(shí)驗(yàn)室內(nèi)部為集成范圍,信息集成的工作主要集中在LIMS與各種分析儀器之間的集成,也就是LIMS的集成。從LIMS的定義來(lái)看,儀器數(shù)據(jù)的自動(dòng)采集,即儀器連接,是LIMS系統(tǒng)中十分重要的模塊,也是用戶衡量LIMS實(shí)施成功與否的一個(gè)重要指標(biāo)。下面就跟譜標(biāo)小編一起來(lái)詳細(xì)看看吧~
將儀器連接到LIMS的好處是顯而易見(jiàn)的。讓儀器進(jìn)入LIMS的集成后,由分析儀器到LIMS的自動(dòng)數(shù)據(jù)傳輸將代替測(cè)試和質(zhì)量控制結(jié)果數(shù)據(jù)的鍵盤輸入,從而避免了手工模式下的撰抄錯(cuò)誤。數(shù)據(jù)自動(dòng)傳輸通常是通過(guò)LIMS對(duì)數(shù)據(jù)文件的讀取來(lái)完成的,數(shù)據(jù)文件通常存放在LIMS所跟蹤掃描的某個(gè)目錄,它是以特定的格式來(lái)組織和傳輸?shù)?,以確保數(shù)據(jù)能夠準(zhǔn)確無(wú)誤地轉(zhuǎn)移到LIMS系統(tǒng)合適的數(shù)據(jù)表中。
儀器接口的類型
實(shí)驗(yàn)室中儀器與LIMS的接口種類繁多,但是從接口的模式來(lái)看,大致可分為以下幾種:LIMS與儀器工作站的雙向傳輸;LIMS與儀器工作站的單向傳輸;LIMS與無(wú)工作站儀器的單向傳輸。
基于儀器文件的儀器集成與LIMS的集成的實(shí)現(xiàn)
對(duì)于可與LIMS連接實(shí)現(xiàn)LIMS與儀器工作站的雙向傳輸和單向傳輸?shù)膬x器,LIMS是從存儲(chǔ)在本地硬盤或者網(wǎng)絡(luò)硬盤上的儀器產(chǎn)生的數(shù)據(jù)文件中提取數(shù)據(jù),并把提取到的有用數(shù)據(jù)映射到LIMS中。該儀器可以沒(méi)有連接到工作站但是它必需把它的數(shù)據(jù)輸送到一個(gè)LIMS可以訪問(wèn)的地方。
儀器獲取數(shù)據(jù)的過(guò)程如下:
1)從儀器獲取數(shù)據(jù)到LIMS管理系統(tǒng)應(yīng)用。把儀器文件存儲(chǔ)到指定的目錄下,LIMS會(huì)定期掃描該文件夾。
2)從儀器數(shù)據(jù)中提取信息,根據(jù)設(shè)定的解析腳本,LIMS提取儀器文件數(shù)據(jù)。
3)使用提取的儀器數(shù)據(jù)。根據(jù)預(yù)先定義好的映射腳本,LIMS把提取出來(lái)的數(shù)據(jù)映射到相關(guān)樣品的結(jié)果中。
從儀器數(shù)據(jù)中提取信息。根據(jù)在儀器屬性里面定義好的的解析腳本,LIMS提取儀器文件數(shù)據(jù)里面的相關(guān)信息。所謂解析腳本(Parsing Seript)就是一種允許你從儀器文件提取或者解析各種信息的儀器控制腳本,解析腳本可應(yīng)用于各種格式的儀器數(shù)據(jù)并可應(yīng)用于“實(shí)時(shí)”,例如當(dāng)數(shù)據(jù)接收時(shí)??梢赃@樣理解解析腳本這個(gè)概念:解析腳本就是一系列的導(dǎo)航,指引LIMS如何讀取數(shù)據(jù)文件,即引導(dǎo)LIMS去“忽略”文件中大多數(shù)的內(nèi)容而僅僅“記住”規(guī)定的項(xiàng)目。這些導(dǎo)航是由一系列需要設(shè)定參數(shù)的命令組成。
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